En su reciente experiencia como técnico tuvo problemas con el club Sporting Cristal de Perú, donde no llegó a ninguna negociación y resultó regalando 30 días con su cuerpo técnico.

Alexis Mendoza, ex jugador del Atlético Junior, América de Cali y Veracruz de México, hoy a sus 57 años, es oficialmente el director técnico del Poderoso de la Montaña, Independiente Medellin. Los ánimos de la hinchada paisa es baja, ya que durante la campaña que realizaron al inicio de la temporada quedaron fuera en los octavos de final.
En los últimos 10 años, Independiente Medellín ha contado con 13 técnicos, demostrando una evidente inestabilidad del equipo antioqueño, que se refleja en los bajos resultados deportivos.
Alexis Mendoza después de ser el defensa central de la Selección, se ha dedicado a la dirección técnica desde hace 17 años:
- Debutó como director técnico del Junior (2002)
- Alianza Petrolera (2003)
- Selección Olímpica de Honduras (2008)
- Fue asistente técnico de Reinaldo Rueda con la Selección Colombia, Honduras y Ecuador
- Junior de Barranquilla (2015-16)
- Independiente del Valle (2017)
- Junior de Barranquilla (2018)
- Sporting Cristal (Enero 2019)
- Actualmente director técnico del Independiente Medellín
Hoy Alexis Mendoza fue presentado en el Hotel Dann de Medellín, como el nuevo director técnico del Rojo de la Montaña a medios de comunicación.
Sus primeras declaraciones con el Deportivo Independiente Medellin