Los que iniciarán en segunda fase serán Santa Fe y Junior. Santa Fe contra Macará o Táchira y Junior frente a Wanderers u Olimpia, superando a sus rivales entrarían a fase de grupos.
Por otro lado, está Millonarios y Nacional. El cuadro embajador debe enfrentarse ante Independiente, Deportivo Lara y Corinthians. El conjunto verdolaga tendrá como rivales a Colo Colo, Bolívar de Bolivia y Delfín de Ecuador.
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En dado caso que Santa Fe pase a tercera fase, es decir, fase de grupos, se enfrentará al ganador de la llave entre Santiago de Wanderers y Melgar. Junior tendría que enfrentarse en esta misma instancia ante el ganador entre Carabobo y Guaraní.